工厂-mPLoc swMATH ID: 22435 软件作者: 周,K.-C。;沈海波(Shen,H.-B.)。 描述: Plant-mPLoc:一种自上而下的策略,用于增强预测植物蛋白质亚细胞定位的能力。蛋白质组学和细胞生物学的基本目标之一是确定蛋白质在各种细胞器和通路中的功能。蛋白质亚细胞位置的信息可以为揭示其功能和理解它们在细胞网络系统中如何相互作用提供有用的见解。现有的植物蛋白质亚细胞定位预测方法大多只能覆盖三个或四个定位位点,没有一种方法可以用于处理同时存在于两个或两个以上不同位置的多重植物蛋白质。实际上,这种复合蛋白质可能具有特别值得注意的特殊生物功能。本研究致力于从上述两个方面改进现有的植物蛋白质亚细胞定位预测因子。通过三种不同的伪氨基酸组成模式,综合基因本体信息、功能域信息和序列进化信息,开发了一种新的预测因子“Plant-mPLoc”。它可用于鉴定以下12个定位位点中的植物蛋白质:(1)细胞膜,(2)细胞壁,(3)叶绿体,(4)细胞质,(5)内质网,(6)细胞外,(7)高尔基体,(8)线粒体,(9)细胞核,(10)过氧化物酶体,(11)质体,(12)液泡。与现有的植物蛋白质亚细胞定位预测方法相比,新的预测方法更加强大和灵活。特别是,它还具有处理多重定位蛋白质的能力,这超出了任何现有的专门用于识别植物蛋白质亚细胞定位的预测因子的能力。作为一个用户友好的网络服务器,Plant-mPLoc可以在http://www.csbio.sjtu.edu.cn/bioinf/plant-multi/。此外,为了方便绝大多数实验科学家,我们提供了一个循序渐进的指南,介绍如何使用网络服务器获得所需的结果。预计本文中提出的Plant-mPLoc预测器将成为植物科学以及所有相关领域中非常有用的工具。 主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20596258 相关软件: 细胞PLoc;欧盟-mPLoc;iLoc-Euk公司;iLoc-Virus病毒;GPCR-2L型;iLoc-Gpos公司;iLoc-Hum公司;伦敦银行支持向量机;iLoc-工厂;Gneg-mPLoc公司;哼-mPLoc;机密P;GPCR-CA公司;GPCR-GIA公司;四-2L;欧洲公共图书馆;爆炸;PSI-爆炸;Memtype-2L型;Hum-位置 引用于: 26文件 全部的 前5名58位作者引用 三 马苏德·海亚特 三 阿西福拉·汗 三 梅,苏玉 2 周国成 2 李涛 1 巴巴克·纳贾尔·阿拉比 1 蔡璐 1 崔向军 1 de Avila e Silva,谢拉 1 邓乃阳 1 丁慧 1 杜普峰 1 段欣 1 塞尔吉奥·埃切韦里加雷 1 埃斯马埃利,阿布拉格哈塞姆 1 冯勇 1 格哈特,Günther J.L。 1 郭飞 1 胡东刚 1 胡雪海 1 黄超 1 姜伟 1 焦亚森 1 卡瓦西 1 Kou,高山 1 Kung,孙园 1 李倩忠 1 林浩 1 刘国庆 1 刘佳 1 陆金龙 1 吕英丽 1 阿卜杜勒·马吉德 1 Man-Wai Mak 1 米什拉,普贾 1 哈桑,莫哈巴特卡 1 马吉德·穆罕默德·贝吉 1 穆萨维·莫瓦赫迪(Ali Akbar Moosavi-Movahedi) 1 贝扎德·莫西里 1 Ganapati熊猫 1 帕拉斯·纳特·潘迪 1 邱志军 1 任贤文 1 梅迪·萨德吉 1 萨胡、斯坦舒·塞哈尔 1 沈以南 1 唐继军 1 万世彪 1 王西成 1 王勇翠 1 吴志成 1 肖宣 1 杨磊 1 袁景琦 1 张春华 1 张胜利 1 张向孙 1 左永春 2篇连载文章中引用 23 理论生物学杂志 三 计算生物学和化学 全部的 前5名在6个字段中引用 26 生物学和其他自然科学(92-XX) 10 计算机科学(68至XX) 4 统计学(62-XX) 1 数值分析(65-XX) 1 运筹学、数学编程(90-XX) 1 信息与通信理论、电路(94-XX) 按年份列出的引文