iSuc-选择权 swMATH ID: 22429 软件作者： 贾，J。；刘，Z。；Xiao，X。；刘，B。；周，K.-C。 描述： iSuc-PseOpt：通过将序列耦合效应纳入伪组分并优化不平衡训练数据集，识别蛋白质中的赖氨酸琥珀酸化位点。琥珀酰化是一种翻译后修饰（PTM），在蛋白质分子的Lys（K）残基上添加琥珀酰基团。赖氨酸琥珀酰化在协调各种生物过程中发挥着重要作用，但它也与一些疾病有关。因此，我们在基础研究和药物开发方面都面临着以下问题：给定一个含有许多Lys残基的无特征蛋白质序列，其中哪一个可以被琥珀酰化，哪一个不能？随着后基因组时代产生的蛋白质序列雪崩，这个问题的答案变得更加迫切。幸运的是，蛋白质中琥珀酰化位点的统计显著性实验数据最近已经可用，这是开发解决此问题的计算方法的不可或缺的先决条件。通过将序列耦合效应纳入一般伪氨基酸组成，并使用KNNC（K近邻清洗）处理和IHTS（插入假设训练样本）处理来优化训练数据集，开发了一个名为iSuc-PseOpt的预测器。严格的交叉验证表明，它显著优于现有方法。iSuc-PseOpt的用户友好的web服务器已在http://www.jci-bioinfo.cn/iSuc-PseOpt在这里，用户可以轻松地获得他们想要的结果，而无需经历复杂的数学方程。 主页： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26723495 相关软件： pSuc-Lys公司；综合布线；iPTM毫升；iRNA-PseColl基因；pLoc-动物；2L小核糖核酸；iRSpot-EL接口；pLoc-mEuk公司；iRSpot-PseDNC公司；国际RNA-AI；普南-PC；iPromoter-2L型；iCar-PseCp公司；pLoc-工厂；iDNA6mA-PseKNC公司；iKcr心理健康；pLoc-mGneg公司；pSumo光盘；iRNA-2甲基；pLoc-m病毒 引用于： 23文件 全部的 前5名77位作者引用 4 马苏德·海亚特 三 周国成 2 谢尔·阿夫扎尔·汗 2 宁，乔 2 王世元 2 肖宣 2 杨磊 2 赵晓伟 2 左永春 1 谢赫·阿迪利娜 1 贾马尔·艾哈迈德 1 赛义德·艾哈迈德 1 沙希德·阿克巴尔 1 穆罕默德·阿里夫 1 陈晓文 1 程翔 1 Chong，Kil To村 1 崔晓文 1 蒂塔拉吉·达什 1 阿卜杜拉·德赞吉 1 杜俊伟 1 杜普峰 1 段欣 1 马里兰州Dewan Farid 1 傅毅 1 瓦卡尔侯赛因 1 纳迪姆·伊克巴尔 1 梅伦·贾米勒 1 Jan，扎胡尔 1 纪金超 1 贾苍志 1 贾建华 1 焦亚森 1 朱哲 1 可汗，穆斯林 1 亚瑟·达尼亚尔·汗 1 苏尼尔·普兰特·拉尔 1 李珊 1 李晓燕 1 约斯万·洛佩兹 1 陆千子 1 吕英丽 1 马志强 1 Manimegalai，D。 1 梅，胡安 1 雅各布·迈克尔森 1 苏坎塔·蒙达尔 1 穆亚双 1 Pai，Priyadarshini P。 1 潘毅 1 彭彦军 1 邱、王仁 1 邱文英 1 努曼·拉苏尔 1 E.Siva桑卡里 1 阿卜杜勒·萨塔尔 1 阿洛克·夏尔马 1 斯瓦克哈尔沙塔布达 1 苏东青 1 Ghazaleh Taherzadeh 1 希拉尔·塔亚拉 1 津田达彦 1 王丽东 1 王明辉 1 王世云 1 杨青（Yang，Qing） 1 尹明浩 1 于斌 1 于兆敏 1 张宏瑞 1 张琪 1 张瑞军 1 张胜利 1 张，叶 1 赵，季 1 周，孟 1 邹全（音） 连载1篇 23 理论生物学杂志 在5个字段中引用 23 生物学和其他自然科学（92-XX） 11 计算机科学（68至XX） 7 统计学（62-XX） 1 组合数学（05-XX） 1 运筹学、数学规划（90-XX） 按年份列出的引文