iDHS-EL公司 swMATH ID: 22426 软件作者: 刘,B。;朗·R。;周,K.-C。 描述: iDHS-EL:通过将三种不同模式的伪核苷酸合成融合到集成学习框架中来识别DNase I超敏位点。动机:调控DNA元素与DNaseⅠ超敏位点(DHS)相关。因此,DHS的鉴定将为深入研究非编码基因组区域的功能提供有用的见解。结果:在本研究中,我们利用集成学习框架的策略,提出了一种新的预测因子iDHS-EL,用于识别DHS在人类基因组中的位置。它是通过将三个单独的随机森林(RF)分类器融合到一个集合预测器中而形成的。这三个RF算子分别基于一般伪核苷酸组成(PseKNC)的三种特殊模式:(i)kmer,(ii)反向补体kmer和(iii)伪二核苷酸组成。已经证明,新的预测器在准确性和稳定性方面显著优于相关的最新方法。可用性和实现:为了方便大多数实验科学家,iDHS-EL的web服务器位于http://bioinformatics.hitsz.edu.cn/iDHS-EL这是有史以来建立的第一个用于识别DHS的web服务器预测器,通过它,用户可以轻松获得所需的结果,而无需仔细查看数学细节。我们预计IDHS-EL:将成为基因组分析的一个非常有用的高通量工具。 主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27153623 相关软件: 综合布线;pSuc-Lys公司;普南PC;iSuc-选择权;iEnhancer-2L型;iPPBS-光学;iPro54-PseKNC;pLoc-m病毒;iRNA-PseColl基因;2L-piRNA;pLoc-工厂;pLoc-mGneg公司;iRSpot-EL接口;pLoc-mEuk公司;pLoc-动物;iRSpot-PseDNC公司;iPTM-mLys公司;iDNA6mA-PseKNC公司;iRNA-PseU基因;iProt-Sub(iProt-Sub) 引用于: 10文件 全部的 前5名34位作者引用 2 王世元 2 杨磊 2 左永春 1 贾马尔·艾哈迈德 1 贾苍之 1 陈晓文 1 周国成 1 杜普峰 1 傅毅 1 马苏德·海亚特 1 瓦卡尔侯赛因 1 纳迪姆·伊克巴尔 1 梅伦·贾米勒 1 焦亚森 1 穆赫塔吉·汗 1 可汗,穆斯林 1 谢尔·阿夫扎尔·汗 1 亚瑟·达尼亚尔·汗 1 陆千子 1 吕英丽 1 马尼梅加莱,D。 1 马库布尔,H.F。 1 梅,胡安 1 穆图·克里希南,S。 1 潘毅 1 青、杨 1 努曼·拉苏尔 1 萨布,M.法兹利 1 E.Siva桑卡里 1 苏东青 1 李桃英 1 张琪 1 赵,季 1 周,孟 2篇连载文章中引用 9 理论生物学杂志 1 数学生物科学 在4个字段中引用 10 生物学和其他自然科学(92-XX) 4 计算机科学(68至XX) 2 统计学(62-XX) 1 组合数学(05-XX) 按年份列出的引文