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iDHS-EL公司

swMATH ID: 22426
软件作者: 刘,B。;朗·R。;周,K.-C。
描述: iDHS-EL:通过将三种不同模式的伪核苷酸合成融合到集成学习框架中来识别DNase I超敏位点。动机:调控DNA元素与DNaseⅠ超敏位点(DHS)相关。因此,DHS的鉴定将为深入研究非编码基因组区域的功能提供有用的见解。结果:在本研究中,我们利用集成学习框架的策略,提出了一种新的预测因子iDHS-EL,用于识别DHS在人类基因组中的位置。它是通过将三个单独的随机森林(RF)分类器融合到一个集合预测器中而形成的。这三个RF算子分别基于一般伪核苷酸组成(PseKNC)的三种特殊模式:(i)kmer,(ii)反向补体kmer和(iii)伪二核苷酸组成。已经证明,新的预测器在准确性和稳定性方面显著优于相关的最新方法。可用性和实现:为了方便大多数实验科学家,iDHS-EL的web服务器位于http://bioinformatics.hitsz.edu.cn/iDHS-EL这是有史以来建立的第一个用于识别DHS的web服务器预测器,通过它,用户可以轻松获得所需的结果,而无需仔细查看数学细节。我们预计IDHS-EL:将成为基因组分析的一个非常有用的高通量工具。
主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27153623
相关软件: 综合布线;pSuc-Lys公司;普南PC;iSuc-选择权;iEnhancer-2L型;iPPBS-光学;iPro54-PseKNC;pLoc-m病毒;iRNA-PseColl基因;2L-piRNA;pLoc-工厂;pLoc-mGneg公司;iRSpot-EL接口;pLoc-mEuk公司;pLoc-动物;iRSpot-PseDNC公司;iPTM-mLys公司;iDNA6mA-PseKNC公司;iRNA-PseU基因;iProt-Sub(iProt-Sub)
引用于: 10文件

2篇连载文章中引用

9 理论生物学杂志
1 数学生物科学

按年份列出的引文