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iDNA-程序

swMATH ID: 22410
软件作者: Liu,B.,Xu,J.,Lan,X.,Xu。
描述: iDNA-Prot:使用灰色模型的随机森林识别DNA结合蛋白。DNA结合蛋白在各种细胞过程中起着至关重要的作用。开发高通量工具以快速有效地识别DNA结合蛋白是基因组注释领域的主要挑战之一。尽管在这方面已经做出了许多努力,但还需要进一步努力来提高预测能力。通过将特征合并到通过“灰色模型”从蛋白质序列中提取的伪氨基酸组成的一般形式中,并采用随机森林运算引擎,我们提出了一个新的预测因子,称为iDNA-Prot,用于仅基于其氨基酸序列信息将未表征的蛋白质鉴定为DNA结合蛋白或非DNA结合蛋白。iDNA-Prot的总成功率为83.96
主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21935457
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