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GPCR-2L型

swMATH ID: 22409
软件作者: Xiao,X。;王,P。
描述: GPCR-2L:通过杂交两种不同模式的伪氨基酸组成预测G蛋白偶联受体及其类型。G蛋白偶联受体(GPCR)是治疗药物最常见的靶点之一。随着后基因组时代新生成的蛋白质序列的大量涌现,为了加快药物发现过程,开发一种自动方法来快速识别GPCR及其类型是非常必要的。通过将两种不同的伪氨基酸组成模式(PseAAC):功能域PseAAA和低频傅里叶谱PseAAB杂交,开发了一种新的预测因子。新的预测因子称为GPCR-2L,其中“2L”表示它是一个两层预测因子:第一层预测引擎用于识别查询蛋白是否为GPCR;如果是,则预测将自动继续,以进一步确定其属于以下六种类型之一:(1)视紫红质样(A类)、(2)分泌素样(B类)、、(3)代谢型谷氨酸/信息素(C类)、和(4)真菌信息素(D类)、或(5)cAMP受体(E类)或(6)卷曲/光滑家族(F类)。GPCR-2L在鉴定蛋白质为GPCR或非GPCR方面的总成功率超过97.2
主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21180772
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