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swMATH ID: 22402
软件作者: 曹东升、青松旭、易曾亮
描述: propy:生成Chou的PseAAC的各种模式的工具。摘要:序列衍生的结构和理化特征经常用于分析和预测蛋白质和肽的结构、功能、表达和相互作用谱。为了促进蛋白质和肽的广泛研究,我们开发了一个免费的开源python软件包,称为propy(propy),用于计算氨基酸序列中广泛使用的蛋白质和肽结构和物理化学特征。它计算了由13个特征组成的5个特征组,包括氨基酸组成、二肽组成、三肽组成、归一化Moreau-Broto自相关、Moran自相关、Geary自相关、序列顺序耦合数、拟序列顺序描述符、组成,各种结构和物理化学性质的转变和分布以及两种类型的伪氨基酸组成(PseAAC)描述符。这些特征通常可以被视为周的不同PseAAC模式。此外,它还可以根据用户定义的属性轻松计算前面的描述符,这些属性可以从AAindex数据库中自动获得。可用性:python包propy可以通过http://code.google.com/p/protpy/downloads/list,它在Linux和MS-Windows上运行。
主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23426256
相关软件: iRSpot-PseDNC公司;PseAAC-建筑商;iSNO-PseAAC公司;综合布线;PseAAC公司;iLoc-Hum公司;国际RSpot-TNCPseAAC;iSNO-AAP航空公司;PseAAC-概述;iNuc-PseKNC;位置传感器;PseKNC公司;iPPI-Esml接口;iPro54-PseKNC;iNuc-PhysChem;pSuc-Lys公司;iDNA-甲基;iHyd-PseAAC公司;iAMP-2L型;iLoc-动物
引用于: 26文件

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