财产 swMATH ID: 22402 软件作者: 曹东升、青松旭、易曾亮 描述: propy:生成Chou的PseAAC的各种模式的工具。摘要:序列衍生的结构和理化特征经常用于分析和预测蛋白质和肽的结构、功能、表达和相互作用谱。为了促进蛋白质和肽的广泛研究,我们开发了一个免费的开源python软件包,称为propy(propy),用于计算氨基酸序列中广泛使用的蛋白质和肽结构和物理化学特征。它计算了由13个特征组成的5个特征组,包括氨基酸组成、二肽组成、三肽组成、归一化Moreau-Broto自相关、Moran自相关、Geary自相关、序列顺序耦合数、拟序列顺序描述符、组成,各种结构和物理化学性质的转变和分布以及两种类型的伪氨基酸组成(PseAAC)描述符。这些特征通常可以被视为周的不同PseAAC模式。此外,它还可以根据用户定义的属性轻松计算前面的描述符,这些属性可以从AAindex数据库中自动获得。可用性:python包propy可以通过http://code.google.com/p/protpy/downloads/list,它在Linux和MS-Windows上运行。 主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23426256 相关软件: iRSpot-PseDNC公司;PseAAC-建筑商;iSNO-PseAAC公司;综合布线;PseAAC公司;iLoc-Hum公司;国际RSpot-TNCPseAAC;iSNO-AAP航空公司;PseAAC-概述;iNuc-PseKNC;位置传感器;PseKNC公司;iPPI-Esml接口;iPro54-PseKNC;iNuc-PhysChem;pSuc-Lys公司;iDNA-甲基;iHyd-PseAAC公司;iAMP-2L型;iLoc-动物 引用于: 26文件 全部的 前5名62位作者引用 6 周国成 5 马苏德·海亚特 4 肖宣 2 法曼·阿里 2 谢丽尔·勃拉纳姆 2 杜普峰 2 瓦卡尔侯赛因 2 贾建华 2 焦亚森 2 谢尔·阿夫扎尔·汗 2 亚瑟·达尼亚尔·汗 2 亚历山德拉·卢米尼 2 洛丽斯·南尼 2 努曼·拉苏尔 1 贾马尔·艾哈迈德 1 穆罕默德·阿里夫 1 穆罕默德·雷扎·巴赫蒂亚利扎德 1 曼达纳州贝巴哈尼 1 尼埃拉·比斯沃斯 1 曹俊哲 1 陈伟 1 程翔 1 Chong,Kil To村 1 阿卜杜拉·德赞吉 1 丁辉 1 曼苏尔·易卜拉希米 1 伊斯梅尔·易卜拉希米 1 范国良 1 冯、彭敏 1 顾红红 1 佐里·哈吉沙里菲 1 黄超 1 梅伦·贾米勒 1 Jan,扎胡尔 1 朱哲 1 Khan,Muazam Ali先生 1 扎赫尔·乌拉·汗 1 拉文德拉·库马尔 1 班达纳库马里 1 李倩忠 1 李晓燕 1 林浩 1 刘冰翔 1 刘,子 1 詹姆斯·莱昂斯(James E.Lyons)。 1 马志强 1 闵建良 1 哈桑·穆罕默德 1 马吉德·穆罕默德·贝吉 1 苏坎塔·蒙达尔 1 穆罕默德·莫拉迪·沙赫巴巴克 1 宁,乔 1 Pai,Priyadarshini P。 1 Paliwal,Kuldip K。 1 梅因·皮里亚耶 1 邱、王仁 1 阿洛克·夏尔马 1 阿比希哈·斯利瓦斯塔瓦 1 希拉·塔亚拉 1 王璞 1 袁景奇 1 赵小伟 2篇连载文章中引用 25 理论生物学杂志 1 医学中的计算和数学方法 在3个字段中引用 26 生物学和其他自然科学(92-XX) 8 计算机科学(68至XX) 6 统计学(62-XX) 按年份列出的引文