CVTree3公司

基于全基因组和无比对的原核系统发育和分类学的CVTree3网络服务器。一个可靠的系统发育学和一个客观的原核生物分类学应该彼此一致,并最终遵循基因组数据。随着测序基因组的数量达到数万个,树推理和与分类学的详细比较都是一个巨大的挑战。我们现在在最新版本3.0中提供了一个解决方案,它是免费的和基于全基因组的web服务器CVTree3。服务器驻留在一个64核的集群中,并配备了一个交互式的、可折叠的、可扩展的树状显示。它能够比较从领域到物种和菌株的所有分类学等级的树木分枝顺序和原核分类。CVTree3允许按分类单元名称查询和血统修改试验。此外,它报告了一个单系和非单系各级分类群的摘要,以及产生打印质量的子树图。在概述了CVTree方法的回顾性验证之后,描述了新服务器在原核生物大分类和一些新测序基因组的分类位置确定方面的作用。此外,还总结了CVTree和16srrna分析在可能的分类修订方面的一些差异。CVTree3对所有用户都是免费访问的http://tlife.fudan.edu.cn/cvtree3/没有登录要求。