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NeAT公司

swMATH ID: 21914
软件作者: Brohee S等人。
描述: NeAT:用于分析生物网络、簇、类和路径的工具箱。网络分析工具(NeAT)(http://rsat.ulb.ac.be/nient(网址)/)提供用户友好的web访问,以访问用于网络(图形)和簇分析的模块化工具集合(例如微阵列簇、函数类等)。第一组工具支持对图形的基本操作(两个图形之间的比较、一组输入节点的邻域、路径查找和图形随机化)。另一组程序在网络和集群之间建立连接(基于图形的集群、集群发现和集群到网络的映射)。工具箱还包括用于检测簇/类之间重要交叉点的程序(例如,共表达簇与功能类基因)。NeAT旨在处理大型数据集,并提供一个灵活的工具箱,用于分析存储在各种数据库中的生物网络(蛋白质相互作用、调节和代谢)或从高通量实验(双杂交、质谱和微阵列)中获得的生物网络。网络界面将预先定义的分析流中的程序相互连接,从而能够解决有关感兴趣网络的一系列问题。每个工具也可以通过输入特定分析的自定义数据来单独使用。NeAT还可以用作web服务(SOAP/WDL接口),以便设计编程工作流并将其与其他可用资源集成。
主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18524799
相关软件: 美杜莎;jClust公司;缝合
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