冯·贝塔兰菲 swMATH ID: 21891 软件作者： 弗莱明，R.M.T。；蒂勒，I。 描述： von Bertalanffy 1.0：热力学约束代谢模型的COBRA工具箱扩展。动机：在代谢的基因组规模化学计量模型的通量平衡分析中，主要约束是摄取或分泌速率、稳态质量守恒假设和反应方向。在这里，我们基于热力学第二定律对每个反应的应用，介绍了一种用于在多组分基因组尺度模型中定量分配反应方向的算法管道。给定实验或计算估计的标准代谢物种类吉布斯能量和代谢物浓度，算法限制反应吉布斯能量，该能量转换为体内pH值、温度、离子强度和电势。结果：这种跨平台MATLAB对基于COnstraint-Based的重建与分析（COBRA）工具箱的扩展具有计算效率高、文档丰富且开源的特点。可利用性：http://opencobra.sourceforge.net 主页： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3008639/ 依赖项： COBRA公司 相关软件： COBRA工具箱 引用于： 1文件 5位作者引用 1 Ronan M.T.弗莱明。 1 梅斯，C.M。 1 伯恩哈德·帕尔森。 1 迈克尔·桑德斯。 1 叶银玉 连载1篇 1 理论生物学杂志 在1个字段中引用 1 生物学和其他自然科学（92-XX） 按年份列出的引文