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材料检查器

swMATH编号: 21812
软件作者: Cartharius K、Frech K、Grote K、Klocke B、Haltmeier M、Klingenhoff A、Frisch M、Bayerein M、Werner T
描述: MatInspector是一种软件工具,它利用转录因子结合位点的大规模矩阵描述库来定位DNA序列中的匹配。MatInspector的速度几乎与搜索IUPAC字符串的速度一样快,但已被证明可以产生更好的结果。它为匹配项指定质量等级,从而允许基于质量的筛选和选择匹配项。第一版MatInspector在Quandt等人,1995(NAR)中进行了描述。2005年发表了一篇描述MatInspector各种新特性的论文(Cartharius等人,2005,生物信息学)。
主页: https://www.genomatix.de/online_help/help_matinspector/matinspector_help.html
相关软件: JASPAR公司;TRANSFAC公司;gNCA公司;COXPRES数据库;ArrayExpress公司;细胞景观;匹配;TEIRESIAS公司;BioProspector公司
引用于: 4文件

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