DelEnsembleElec公司 swMATH ID: 21782 软件作者: 沃塔普卡,西巷。;卢克·卡扎普拉(Luke Czapla);马克西姆·贾尼洛夫斯基;Rommie E.阿玛罗。 描述: DelEnsembleElec:使用DelPhi计算集合平均静电。提出了一个新的VMD插件,该插件与DelPhi接口,使用泊松-玻尔兹曼方程提供集合平均静电计算。讨论了该方法的一般理论和背景,并给出了插件接口和计算的示例。将此新工具应用于当前生物感兴趣的系统,从显式溶解的全原子分子动力学轨迹中获得两种主要流感病毒糖蛋白血凝素和神经氨酸酶的集合平均静电特性。在这些例子中,详细检查了集合平均静电和从单个结构获得的静电之间的差异,揭示了插件如何成为促进生物系统中静电相互作用建模的强大工具。 主页: https://amarolab.ucsd.edu/delenseblelec.html 相关软件: 琥珀色;供应商管理部;DelPhi网络服务器;产品开发B2PQR;查姆 引用于: 1文件 标准条款 1出版物描述软件,包括1出版物以zbMATH为单位 年份 DelEnsembleElec:使用DelPhi计算集合平均静电。 Zbl 1373.92008年沃塔普卡,西巷。;卢克·卡扎普拉;马克西姆·齐诺夫斯基;Rommie E.阿玛罗。 2013 4位作者引用 1 Rommie E.阿玛罗。 1 卢克·查普拉 1 沃塔普卡,西巷。 1 马克西姆·齐诺夫斯基 连载1篇 1 计算物理中的通信 在1个字段中引用 1 生物学和其他自然科学(92-XX) 按年份列出的引文