动量HMM swMATH编号： 21676 软件作者： 布雷特·麦克林托克（Brett T.McClintock）、西奥·米歇洛特（Theo Michelot） 描述： 用于动物运动的广义隐马尔可夫模型的momentuHMM:R包。离散时间隐马尔可夫模型（HMM）已经成为从遥测数据推断潜在动物行为的非常流行的工具。这里我们介绍一个开源的R包momentuHMM，它解决了现有HMM软件中的许多缺陷。其特点包括：1）数据预处理和可视化；2） 无限数量数据流和潜在行为状态的用户特定概率分布；3） 有偏和相关的随机行走运动模型，包括与吸引力或排斥力相关的“活动中心”；4） 使用大多数R用户熟悉的公式进行参数协变量建模的用户特定设计矩阵和约束；5） 考虑测量误差和时间不规则或缺失数据的多种插补方法；6） 时空协变量栅格数据的无缝集成；7） 用于循环和其他复杂模式的余弦和样条模型；8） 模型校核与选择；9）仿真。momentuHMM极大地扩展了现有HMM软件的功能，同时考虑了与遥测数据相关的常见挑战。因此，它有助于更现实的假设驱动的动物运动分析，而非国家学者迄今为止基本上无法进行这些分析。虽然受到遥测数据的激励，但该软件包可用于分析HMM可接受的任何类型的数据。鼓励对其他功能感兴趣的从业者联系作者 主页： https://cran.r-project.org/web/packages/momentuHMM/index.html 源代码： https://github.com/cran/momentuHMM网站 依赖项： R（右） 关键词： 定量方法;arXiv q-bio.QM;应用程序;arXiv统计.AP;arXiv公司;R包;生物测井;生物遥测;爬行;移动HMM;状态空间模型;状态切换 相关软件： 移动HMM;R（右）;爬行;ctmm公司;k轨道;英国金融稳定委员会;kfsst公司;跟踪;符合;帕瓦克;物理活动;GGIR公司;加速度计;红细胞（rbl）;diveMove（移动）;rpostgisLT公司;移动风速;驯鹿;相似性度量;野生动物DI 引用于： 8文件 标准文章 1出版物描述软件，包括1出版物以zbMATH为单位 年份 使用多重插补将遥测误差纳入动物运动的隐马尔可夫模型。 Zbl 1388.62344号布雷特·麦克林托克。 2017 全部的 前5名23位作者引用 2 梅文·胡滕（Mevin B.Hooten）。 2 罗兰·兰洛克 1 威廉·H·埃伯哈德。 1 约瑟夫·贝利（Joseph D.Bailey）。 1 巴特·巴拉德（Bart M.Ballard）。 1 简·布拉 1 爱德华·科德林（Edward A.Codling）。 1 菲尔德，克里斯·M。 1 德文·约翰逊。 1 鲁思·金 1 伊桑·劳勒 1 马克·曼格尔 1 安东尼奥·马鲁蒂 1 布雷特·麦克林托克。 1 伊丽莎白·麦克休伦。 1 乔安娜·米尔斯·弗莱明 1 托林·谢弗（Toryn L.J.Schafer）。 1 亨利·沙夫。 1 杰里米·斯特林。 1 Jay A.冯银行。 1 米奇·威格曼。 1 Kim，Whoriskey 1 克里斯托弗·威克尔（Christopher K.Wikle）。 引用于4个系列 5 农业、生物和环境统计杂志 1 Metron公司 1 AStA。统计分析进展 1 理论生物学杂志 在4个字段中引用 7 统计学（62-XX） 6 生物学和其他自然科学（92-XX） 2 总体主题；集合（00-XX） 1 运筹学、数学规划（90-XX） 按年份列出的引文