XMIPP公司

XMIPP:新一代用于电子显微镜的开源图像处理包。基于X-windows的显微图像处理软件包(Xmipp)是一套专门的图像处理程序,主要目的是从透射电子显微镜获得的大量投影图像中获得生物标本的三维重建。八年前,这个公共领域的软件包被引入电子显微镜领域,从那时起它发生了巨大的变化。单粒子投影图像分析的新方法已添加到分类、对比度传递函数校正、角度分配、三维重建、晶体重建等方面。此外,该软件包还扩展了二维晶体和电子层析成像数据的功能。此外,它目前在C++中的实现,具有高度模块化的数据结构和功能设计,为新算法的开发提供了一个方便的环境。在这篇文章中,我们对新一代Xmipp进行了总体概述,它经过重新设计,最大限度地提高了灵活性和模块化程度,有可能促进其在该领域未来标准化工作中的集成。此外,通过关注那些使Xmipp区别于其他可用软件包的开发,我们展示了它对电子显微镜界的附加价值。