Bioclipse公司 swMATH ID: 21445 软件作者： Spjuth O、Alvarsson J、Berg A、Eklund M、Kuhn S、Masak C、Torrance G、Wagener J、Willighagen E、Steinbeck C、Wikberg J。 描述： Bioclipse 2：生命科学的可脚本化集成平台。背景：当代生物学研究整合了邻近的科学领域，以回答系统生物学和药物发现等领域的复杂问题。这需要使用直观且灵活的工具来适应新任务。结果：Bioclipse是一个免费的开源工作台，具有生命科学的高级功能。2.0版是对Bioclipse的彻底改写，为开发人员提供了一个稳定、可扩展的集成平台，为最终用户提供了直观的工作台。所有功能都可以从图形用户界面和内置的新颖领域特定语言中获得，通过输入和结果的高级可视化，支持科学家进行跨学科研究和可再现分析。Bioclipse 2的新组件包括用于化学结构的重写编辑器、支持千兆字节大小文件的多分子表，以及用于序列和对齐的图形编辑器。结论：Bioclipse 2配备了在生物和化学信息学领域进行复杂分析所需的先进工具。Bioclipse 2是基于Eclipse开发的富客户端，它利用当今功能强大的台式计算机提供响应性用户界面，同时还充分利用Web和网络（Web/Cloud）服务进行更高要求的计算或数据检索。Bioclipse 2基于一个高级且广泛使用的服务平台，这一事实确保了广泛的可扩展性，使得添加新算法、可视化以及脚本命令变得容易。面向最终用户的直观工具和可扩展的体系结构使Bioclipse 2成为跨学科和综合研究的理想选择。Bioclipse 2是根据Eclipse公共许可证（EPL）发布的，这是一种灵活的开放源码许可证，允许使用任何许可证的附加插件。Bioclipse 2是用Java实现的，在所有主要平台上都受支持；源代码和二进制文件在http://www.bioclipse.net。 主页： http://www.bioclipse.net/ 相关软件： CDK公司；塔维纳；BioMOBY公司；比尔；屏幕保护程序；春天；公共数学；Jasper报告；布伦；MySQL数据库；冬眠；HBC公司；R（右）；JChemPaint公司；卡林；细胞景观；生物爪哇；UniProt公司；Clustal X公司；XPath（XPath） 引用于： 0个文档 标准条款 1出版物描述软件 年份 Bioclipse 2：生命科学的可脚本化集成平台斯普尤斯，奥拉；乔纳森·阿尔瓦尔森（Jonathan Alvarsson）；阿维德·伯格（Arvid Berg）；马丁·埃克隆德（Martin Eklund）；库恩，斯特凡；卡尔·梅萨克；Gilleain M.托伦斯。；约翰·瓦格纳（Johannes Wagener）；埃贡·L·威利根。；克里斯托弗·斯坦贝克；Jarl E.S.Wikberg。 2009