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SiGN-SSM公司

swMATH编号: 21443
软件作者: 吉诺里田田;鲁伊山口;Imoto,Seiya;奥萨姆·赫洛泽(Osamu Hirose);吉田良彦;长崎,Masao;宫野,佐藤
描述: Sign-SSM:使用状态空间模型估计基因网络的开源并行软件。SiGN-SSM是一个开源的基因网络评估软件,能够在PC和大规模并行超级计算机上并行运行。该软件估计状态空间模型(SSM),这是一个适用于分析短时间和/或复制时间序列基因表达谱的统计动态模型。SiGN SSM实现了一种新的参数约束,有效地稳定了估计模型。此外,通过使用超级计算机,它能够在实际时间内通过统计置换测试确定基因网络结构。SiGN-SSM不仅适用于分析基因之间的时间调控依赖性,而且还适用于从时间序列表达谱中提取差异调控基因。
主页: http://sign.hgc.jp/signssm(签名)/
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