PhagoSight公司 swMATH ID: 21434 软件作者： 亨利·K·M。；酶，L。；Ramos-Lopez，C.F。；Lieschke，G.J。；伦肖，S.A。；雷耶斯·阿尔达索罗，C.C。 描述： PhagoSight：用于斑马鱼模型中荧光中性粒细胞和巨噬细胞迁移分析的开源MATLAB®软件包。斑马鱼幼虫中性粒细胞迁移越来越多地被用作研究这些白细胞对细胞炎症反应不同决定因素的反应的模型。然而，从宽视野或共焦显微镜获得的多维数据集中提取描述中性粒细胞行为的全面信息仍然是一项挑战。在这里，我们描述了PhagoSight，这是一个用于分割、跟踪和可视化三维迁移吞噬细胞的开源软件包。PhagoSight中的算法提取了大量的测量数据，总结了中性粒细胞的行为，但这可能适用于任何移动的荧光细胞。为了获得一组有用的变量来量化中性粒细胞迁移行为的各个方面，并证明PhagoSight的实用性，我们评估了迁移中性粒细胞体积的变化。随着中性粒细胞向受伤斑马鱼的伤口区域迁移，细胞体积增加。PhagoSight在GNU通用公共许可证下以MATLAB®m文件的形式公开提供。合成数据集和综合用户手册可从http://www.phalogisight.org。 主页： http://www.aghavist.org 依赖项： Matlab公司 相关软件： 趋化作用 引用于： 1文件 5位作者引用 1 Konstantinos N.Blazakis。 1 阿诺蒂达·麦兹沃伊 1 雷耶斯·阿尔达索罗、康斯坦丁诺·卡洛斯 1 风格，凡妮莎 1 文卡塔拉曼，钱德拉塞卡 连载1篇 1 计算物理杂志 在2个字段中引用 1 变分法与最优控制；最优化（49至XX） 1 生物学和其他自然科学（92-XX） 按年份列出的引文