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TADSim公司

swMATH ID: 20723
软件作者: Susan M.Mniszewski。;克里斯托夫·琼汉斯;选民,Arthur F。;丹尼·佩雷斯(Danny Perez);斯蒂芬·艾登本兹。
描述: TADSim:基于离散事件的性能预测,用于温度加速动力学。下一代高性能计算将需要更具可扩展性和灵活性的性能预测工具来评估与科学应用程序和硬件架构相关的软硬件协同设计选择。我们提出了一类新的工具,称为应用程序模拟器,它使用并行离散事件模拟来实现大规模科学应用程序的参数化快速运行代理。算法方法和硬件选项的参数化选择为设计探索提供了丰富的空间,并允许我们快速找到性能良好的软件-硬件组合。我们用一个模拟温度加速动力学(TAD)方法的TADSim模拟器来演示我们的方法,该方法是分子动力学加速分子动力学(AMD)方法家族中算法复杂且参数丰富的成员。TAD应用程序的本质是在不占用完整代码的计算开销和资源的情况下捕获的。我们通过识别时间密集型元素,根据这些元素量化算法步骤,将其抽象出来,并通过时间的推移替换它们来实现这一点。我们使用TADSim快速描述长时间运行的仿真代码的运行时性能和算法行为。我们将TADSim扩展到模型算法扩展,例如计算绑定阶段的推测性生成,并预测性能改进,而无需实现这种方法。根据实际TAD代码进行的验证表明,与示例物理系统银表面的演化非常一致。集中参数扫描使我们能够在比实际模拟可能出现的情况多得多的情况下研究算法参数选择。这导致了与性能相关的有趣见解和建议扩展。
主页: http://dl.acm.org/citation.cfm?id=2699715
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