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OncoScore公司

swMATH ID: 20532
软件作者: 丹尼尔·拉马佐蒂(Daniele Ramazzotti)、卢卡·德萨诺(Luca De Sano)、罗伯塔·斯皮内利(Roberta Spinelli)、罗科广场(Rocco Piazza)、卡洛·甘巴科蒂(Carlo Gambacorti Passerini)
描述: OncoScore:测量基因致癌潜能的R包。动机:我们在这里介绍了OncoScore,这是一个开源工具和R包,它实现了一种新的文本挖掘方法,能够根据基因与癌症的关系,根据PubMed上可用的生物医学文献对基因进行排序。OncoScore可以通过动态更新的web查询扫描生物医学文献,并通过考虑引用来衡量每个基因与癌症的关联。该工具的输出是在分析时测量基因与癌症关联强度的分数。可用性和实施:OncoScore可以在GitHub上获得,也可以在bioconductor.org上作为R包获得。此外,对OncoScore的查询也可以在http://www.galseq.com/oncoscore.html。联系人:daniele.ramazzotti@stanford.edul.desano@campus.unimib.it补充信息:补充数据可从生物信息学在线获取。
主页: https://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/OncoScore.html
依赖项: R(右)
相关软件: 生物导体
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