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阵列群集

swMATH ID: 20488
软件作者: 吉田R、Higuchi T、Imoto S、Miyano S。
描述: ArrayCluster:一个分析工具,用于对基因表达谱进行聚类、数据可视化和模块查找。基因表达分析的一个重大挑战是在分子水平上发现几种疾病的未知亚型。这项任务可以通过在大量基因的基础上对采集样本的基因表达模式进行分组来解决。然而,将常用的聚类方法应用于此类数据集很可能会因过度学习而失败,因为要分组的样本数量远小于数据维,数据维等于数据集中涉及的基因数量。为了克服这些困难,我们开发了一种新的基于模型的聚类方法,称为混合因子分析。ArrayCluster是一个免费的软件,用于执行混合因子分析。它为我们提供了一些分析工具,用于聚类DNA微阵列实验、数据可视化和与校准分子亚型相关的基因模块转录的自动检测器等。
主页: 网址:http://www.ism.ac.jp/~higuchi/arraycluster.htm
相关软件: 麦克卢斯特;PGMM公司;R(右);作为136;;clustvarsel公司;特伊根;LISREL公司;TCLUST公司;长clust;vscc公司;奥特里姆;混合物;Selvar俱乐部MV;量化风险管理;Mixmod公司;柔性混音
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