快速地图 swMATH ID: 20452 软件作者： D.M.Gatti、A.A.Shabalin、T.C.Lam、F.A.Wright、I.Rusyn、A.B.Nobel 描述： FastMap：纯合子群体中的快速eQTL定位。动机：基因表达定量性状位点（eQTL）定位测量转录表达和基因型之间的关联，以便找到可能调节转录表达的基因组位置。基因表达和高密度基因型数据的可用性提高了我们在近交系小鼠和其他纯合群体中进行eQTL定位的能力。然而，现有的eQTL作图软件在转录本和标记数量分别为10（5）和10（5。结果：我们提出了一种新的方法，FastMap，用于在具有二元等位基因调用的纯合子近交群体中快速有效地进行eQTL定位。FastMap利用测量的单核苷酸多态性（SNP）的离散性和结构。特别是，SNP被组织成一个基于汉明距离的树，该树通过使用树中父SNP的关联来最小化计算SNP关联所需的算术操作数。FastMap的树可用于在m-SNP窗口上进行单标记映射和单倍型关联映射。这些性能增强还允许基于排列的重要性测试。 主页： https://omictools.com/fastmap-tool 相关软件： PLINK公司；卢比/夸脱；Matlab公司；矩阵eQTL；R（右） 引用于： 1文件 2位作者引用 1 蔡子星 1 曲、太国 连载1篇 1 南京大学学报。自然科学 在1个字段中引用 1 统计学（62-XX） 按年份列出的引文