tkGDE公司

在Tk/A分子工作台上开发了一个简单易用的Tk/A分子工作台。我们描述了一个分子生物学工作台的设计和实现,它允许分析工具的简单集成。该软件使用提供面向对象编程的[incr Tcl]扩展在Tcl/Tk中实现。这个程序叫做tkGDE,由四个主要部分组成。序列编辑器允许用户对生物分子序列执行基本的编辑操作。图形注释编辑器为用户提供序列所有注释特征的图形化概述。输出管理器保留有关分析工具生成的结果的信息。bundle控件允许多个工具自动运行,将数据从一个工具传递到下一个工具。通过在配置文件中描述工具的属性,可以将工具集成到系统中,这大大减少了集成所需的时间。我们给出的结果证明了Tcl/Tk被错误地判断为缓慢且不适合大型项目。为了获得足够的性能,我们利用了Tcl/Tk的特殊特性,即空闲任务和Tk画布小部件中内置的功能。该系统由182个类的34000多行[incr Tcl]代码组成。整个开发过程大约花了一个人一年的时间。

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  1. Pohle,Hans-Peter;Drescher,Bernd:Tcl/Tk高效开发的灵活易用的分子生物学工作台(2000)