林戈 swMATH ID: 20402 软件作者: Joern Toedling、Oleg Sklyar、Tammo Krueger、Matt Ritchie、Wolfgang Huber 描述: R ChIP芯片阵列的研究。Ringo软件包有助于ChIP-ChIP数据的初步分析。该软件包的主要功能是数据读取、质量评估、数据可视化和识别显示ChIP-ChIP富集的基因组区域。该软件包具有处理ChIP-ChIP项目中使用的来自NimbleGen的双色寡核苷酸微阵列的功能,但也包含用于ChIP-chinp数据分析的更通用功能,因为数据是以RGList(原始)或ExpressionSet(预处理)的形式提供的。该软件包使用了生物导体项目其他各种软件包的功能,并提供了额外的ChIP-ChIP和NimbleGen特定功能。 主页: https://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/Ringo.html 依赖项: R(右) 相关软件: 生物导体;R(右);斯塔尔;全球气候变化评估;vsn(vsn);平铺贴图;干红辣椒;利马;阿菲 引用于: 0个文档