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CSAR公司

swMATH ID: 20392
软件作者: Muino J、Kaufmann K、van Ham R、Angenent G、Krajewski P
描述: 生物导体包CSAR:用于分析ChIP-seq数据的统计工具。ChIP-seq数据分析的统计工具。该软件包包括考夫曼等人(2009)《公共科学图书馆·生物学》:7(4):e1000090中描述的统计方法。简言之,考虑到测序后的平均DNA片段大小,该软件计算基因组单核苷酸读富集值。归一化后,使用基于泊松分布的测试对样本和对照进行比较。通过随机排列获得控制错误发现率的测试统计阈值。
主页: https://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/CSAR.html
依赖项: R(右)
相关软件: R(右)乔达LVSmiRNA公司插入子集CloudBLAST(云爆炸)牛基因组逻辑T生物导体RBio云
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