平面NJ swMATH ID: 20300 软件作者: M.Balvoc iu te、A.Spillner、V.Moulton 描述: FlatNJ:一种新的基于网络的方法,用于可视化进化和生物地理关系。分裂网络是一种系统发育网络,可以可视化进化数据中的冲突。我们提出了一种构建这种网络的新方法,称为FlatNetJoining(FlatNJ)。FlatNJ的一个关键特性是,它生成的网络可以绘制在平面上,标签可能出现在网络内部。对于涉及非中性分子标记的复杂数据集,与以前的方法(如拆分和NeighborNet)相比,这可以可视化更多细节。我们通过将FlatNJ应用于进行重组的整个HIV基因组序列、存在祖先序列的珊瑚中的荧光蛋白以及生物地理关系很重要的瘿蜂的线粒体DNA序列来说明FlatNJ的应用。我们发现FlatNJ生成的网络可以促进对基础分子序列数据中遗传变异的研究,特别是可能有助于研究诸如细胞内重组等过程。FlatNJ已在Java中实现,可在www.uea.ac.uk/computing/software/FlatNJ上免费获得。 主页: http://www.uea.ac.uk/computing/software/flatnj 相关软件: QNet公司 引用于: 2文件 4位作者引用 2 安德烈亚斯·斯皮尔纳 1 莫妮卡·巴尔沃奇塔 1 大卫·布莱恩特 1 文森特·莫尔顿。 2篇连载文章中引用 1 订单 1 SIAM离散数学杂志 在4个字段中引用 1 组合数学(05-XX) 1 阶、格、有序代数结构(06-XX) 1 凸和离散几何(52至XX) 1 生物学和其他自然科学(92-XX) 按年份列出的引文