GemCell公司 swMATH ID: 1995 软件作者: 阿米尔·克罗尔(Amir-Kroll),希拉(Hila);阿维塔尔·萨多特;科恩(Irun R.Cohen)。;大卫·哈雷尔 描述: GemCell:建模多细胞生物系统的通用平台生物信息的质量和复杂性需要计算机辅助模拟和分析,以帮助科学家理解和指导实验。虽然活的生物体是由细胞组成的,但实际的基因组和蛋白质组数据尚未形成令人满意的电子工作细胞模型。我们已经着手设计一个用户友好的通用平台GemCell,用于基于整体功能单元的通用可执行单元建模。从细胞开始简化了生命,因为所有细胞基本上都表达五种常见的行为:复制、死亡、运动(包括形状和粘附的改变)、输出(分泌、信号传递等)和输入(接收信号、代谢物、吞噬作用等)。这些行为的细节在GemCell中为特定种类的细胞指定,作为生物特性数据库(DBS)的一部分,该数据库指定了依赖于细胞历史、状态、环境等的细胞属性和功能。DBS以直观的方式设计,因此用户能够容易地插入他们感兴趣的数据。GemCell的通用部分是使用Statecharts构建的,它是一个完整的细胞动态模型,它与环境的交互及其单独或集体产生的行为。模型特异性来自DBS,因此模型执行是由状态图执行,借助于从DBS动态提取的特定数据。我们的长期目标是使GemCell成为一个广泛适用的生物建模和分析平台,为各种生物系统的硅实验、动画、新兴特性发现和假设测试提供用户友好的支持。 主页: http://www.wisdom.weizmann.ac.il/~yaki/GRA/GemCellAnimation.htm 关键词: 生物建模;细胞间行为;可执行建模;复杂系统;状态图 相关软件: Matlab公司;生物CHAM 引用于: 2文件 标准条款 1出版物描述软件,包括1出版物以zbMATH为单位 年份 GemCell:建模多细胞生物系统的通用平台。 Zbl 1132.68809号希拉·阿米尔·克罗尔;阿维塔尔·萨多特;科恩(Irun R.Cohen)。;大卫·哈雷尔 2008 全部的 前5名7位作者引用 2 科恩(Irun R.Cohen)。 2 大卫·哈雷尔 1 希拉·阿米尔·克罗尔 1 索尔·埃夫罗尼 1 阿维塔尔·萨多特 1 雅基·塞蒂 1 娜玛·斯威德林 连载1篇 1 理论计算机科学 在2个字段中引用 2 计算机科学(68至XX) 1 生物学和其他自然科学(92-XX) 按年份列出的引文