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多相非相位

swMATH ID: 19781
软件作者: 亚历山大局;乔迪·克罗托
描述: 多相性:基于家族遗传关联分析的多相性包结果的扩展。当一种疾病有多个亚型或同时分析两种二分法表型时,就会出现多染色体表型。在家族研究中,很少有软件程序提供分析此类表型的选项,也没有一个软件程序实现对人口分层稳健的家族内分析的条件多体logistic回归。我们介绍了Polyunphased,它是Unphased软件包的多染色体表型的扩展,是核心家族遗传关联分析的灵活软件工具。与Unphased一样,Polyunphased是用C++编写的,可以从命令行或Java图形用户界面运行。Polyunphased中的大多数非相位选项仍然可用,包括那些处理缺失的亲本基因型同时保持对种群分层的稳健性的选项,以及建模选项。模拟研究证实了条件logistic回归模型关联参数的最大似然估计的预期统计行为,即当似然函数父项中的相应关联参数设置为0时,但在单独估计这些亲本关联参数时,发现了收敛问题。因此,前一种方法推荐用于多染色体表型。
主页: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28186960
关键词: 条件似然;核心家庭;多元logistic模型
相关软件: 无阶段
引用于: 1文件

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