2D-MH公司

2D-MH:一个基于蛋白质组成氨基酸的物理化学性质生成蛋白质序列图形表示的web服务器。对生物序列进行直观的分析,也可以提供直观的图像分析。本文提出了一种新的二维图,称为“2D-MH”,来表示蛋白质序列。它是通过结合每一个组成氨基酸的侧链质量及其疏水性的信息而形成的。由此产生的图形曲线具有以下特点:(1)无回路或退化的一一对应关系;(2)更好地反映蛋白质序列的固有结构;(3)在显示蛋白质序列的相似性方面清晰可见;(4)对药物靶向重要的突变位点更敏感;(5)能够被用作衡量蛋白质从一个物种到另一个物种的“进化距离”的度量标准。预计所提出的图解法可能成为大规模分析后基因组时代产生的蛋白质序列雪崩的有用工具。作为一个web服务器,2D-MH可以在http://icpr.jci.jx.cn/bioinfo/pplot/2D-MH它可以方便地生成任意数量的蛋白质序列的二维图,并比较它们之间的进化距离。


zbMATH中的参考文献(参考文献21条)

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按年份排序(引用)
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