SegAnnDB公司 swMATH ID: 19542 软件作者: 霍金,T.D.,博埃娃,V.,里盖尔,G.,施莱尔马赫,G。 描述: SegAnnDB:交互式网络基因组分割。动机:DNA拷贝数剖面描述了肿瘤基因组中染色体增益、丢失和断点的区域。尽管已经提出了许多模型来检测这些变化,但在对信号、噪声和特定轮廓的模型进行目视检查之前,尚不清楚哪种模型适合。结果:我们提出了SegAnnDB,一个基于Web的基因组分割计算机视觉系统:首先,目视检查轮廓并手动注释改变的区域,然后SegAnnDB使用数据和注释的数学模型确定精确的改变位置。SegAnnDB促进生物学家和生物信息学家之间的合作,并使用加州大学圣克鲁斯分校的基因组浏览器可视化已知基因的拷贝数变化。可用性和实现:INRIA GForge上的断点项目托管源代码,可以启动Amazon Machine Image,并且可以创建一个演示网站http://bioviz.rocq.inria.fr。 主页: http://bioviz.rocq.inria.fr/ 相关软件: github;峰值分段最佳;工作分解结构;cghseg公司 引用于: 3文件 全部的 前5名7位作者引用 2 托比·迪伦,霍金 1 艾伦·P·本森。 1 保罗·费恩黑德 1 菲利尔、尼亚尔 1 罗伯特·梅德斯通 1 吉勒姆·里盖尔 1 阿努拉格·斯利瓦斯塔瓦 3篇连载文章中引用 1 计算统计学 1 电子统计杂志 1 统计与计算 在1个字段中引用 三 统计学(62-XX) 按年份列出的引文