compHclust公司 swMATH ID: 19128 软件作者: 诺瓦克,Gen;罗伯特·提比拉尼 描述: 互补层次聚类。当应用层次聚类算法从微阵列数据中聚类患者样本时,大多数算法生成的聚类模式往往由具有密切相关表达模式的高差异表达基因组控制。有时,这些基因可能与正在研究的生物过程无关,或者它们的功能可能已经已知。问题是这些基因可能会淹没其他相关或具有新功能的基因的影响。我们提出了一种称为互补层次聚类的程序,旨在揭示这些新基因的结构,而这些新基因并没有那么高表达。仿真研究表明,该程序在应用于各种实例时是有效的。我们还定义了一个称为相对基因重要性的概念,该概念可用于识别给定聚类中的影响基因。最后,我们使用基于相关性的距离度量聚类分析了295名乳腺癌患者的微阵列数据集。互补聚类揭示了一组患者,这些患者与许多已知的预后特征和显著不同的无远处转移概率无关。 主页: https://cran.r-project.org/web/packages/compHclust/index.html 源代码: https://github.com/cran/compHclust网站 依赖项: R(右) 关键词: 层次聚类;微阵列;主要成分;相对基因重要性 相关软件: 奥斯卡;贝叶斯DA;生物导体;COSA公司;预防卒中;格尔姆奈特;R(右) 引用于: 3文件 全部的 前5名6位作者引用 1 埃里克·贝尔 1 查克拉博蒂,苏纳克 1 希拉·盖诺 1 奥雷利·C·洛扎诺。 1 Gen诺瓦克 1 Robert John Tibshirani先生 2篇连载文章中引用 2 计算统计与数据分析 1 生物统计学 在2个字段中引用 三 统计学(62-XX) 1 生物学和其他自然科学(92-XX) 按年份列出的引文