塔姆金 swMATH ID: 19002 软件作者： Ghysels，安；范斯特雷伦（Toon Verstraelen）；Karen Hemelsoet；瓦洛奎，米歇尔；维罗尼克·范·斯佩布罗克 描述： TAMkin：振动分析和化学动力学的通用软件包。TAMkin是一个计算和分析正常模式、热化学性质和化学反应速率的程序。目前，可以分析常用软件程序ADF、CHARMM、CPMD、CP2K、Gaussian、Q-Chem和VASP的输出。法向模态分析可以使用多种高级模型进行，包括标准全Hessian模型、移动块Hessian方法、部分Hessian振动方法、带或不带质量矩阵校正的振动子系统分析、弹性网络模型以及其他组合。TAMkin因其模块化结构而易于扩展。单分子和双分子反应的化学动力学可以用传统的过渡态理论直接分析，包括隧穿修正和内转子精细化。还可以进行灵敏度分析，以便深入了解动力学参数的理论误差范围。两个广泛的例子证明了TAMkin的能力：研究了生物系统腺苷酸激酶的构象变化，以及乙烯加成乙基自由基的反应动力学。通过进行扩展的理论研究，TAMkin可以显著实现自动化，从而突出了批量处理大量数据的重要特征。 主页： http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/ci100099g 引用于： 0个文档