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资本充足率

swMATH ID: 18853
软件作者: 钟仁华;迈克尔·施密特(Michael A.Schmidt)。;伊登·R·马丁。
描述: CAPL:一个有效的关联软件包,使用家庭和病例对照数据,并考虑人群分层。背景:由于有许多可用的全基因组关联研究(GWAS)数据集,我们必须拥有灵活且快速的统计工具,以适应不同的研究设计。我们最近提出了组合APL(CAPL)方法,该方法可以使用家庭和病例对照数据集,并可以解释数据中的人口分层。由于CAPL中使用了计算密集型算法,因此使用高效的并行算法实现CAPL是至关重要的。结果:我们使用了开放消息传递接口(open MPI)和POSIX线程的混合来并行化CAPL,使程序能够在集群环境中运行。我们使用仿真来证明,当并行计算资源可用时,CAPL的并行实现可以在合理的时间框架内分析大型GWAS数据集。结论:由于有许多基于家庭和病例对照设计的GWAS数据集可用,一个灵活有效的工具,如CAPL,将有助于合并数据集,从而大大提高统计能力,并在合理的时间框架内完成分析。
主页: https://bmcbioinformatics.biomedcentral.com/articles/10.1186/1471-2105-12-201
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