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TFGD公司

swMATH ID: 18850
软件作者: 费、张军;Joung,Je-Gun;唐雪梅;郑毅;黄明云;Lee,Je Min;Ryan Mcquinn;Denise M.Tieman。;罗伯·阿尔巴(Rob Alba);哈里·克莱(Harry J.Klee)。;詹姆斯·乔瓦诺尼。
描述: 番茄功能基因组数据库:番茄功能基因组的综合资源和分析包。番茄功能基因组数据库(TFGD)为存储、查询、挖掘、分析、可视化和集成大规模番茄功能基因组数据集提供了全面的资源。该数据库从前面描述的番茄表达数据库中进行功能扩展,包括代谢产物谱和大规模番茄小RNA(sRNA)数据集。已经开发了计算管道来分别处理数据库中存档的微阵列、代谢物和sRNA数据集,TFGD提供了所有分析结果的下载。TFGD还旨在使用户能够通过一组高效的查询界面和分析工具轻松检索生物重要信息,包括改进的阵列探针注释以及识别共表达基因的工具,从基因表达数据集和miRNA靶点显著影响生物过程和生化途径,并整合转录物和代谢物谱以及sRNA和mRNA序列。TFGD中的一套工具和接口允许对最近发布的大规模番茄功能基因组数据集进行智能数据挖掘,并不断扩展。TFGD位于http://ted.bti.cornell.edu。
主页: http://ted.bti.cornell.edu/
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