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Acgh.样条线

swMATH ID: 18847
软件作者: 托马斯·W·菲茨杰拉德。;Lee D.Larcombe。;索莱纳Le Scouarnec;斯蒂芬·克莱顿(Stephen Clayton);戴安娜·拉詹(Diana Rajan);奈杰尔·卡特。;理查德·雷登
描述: aCGH中。样条-用于aCGH染料偏置归一化的R包。动机:基于阵列的比较基因组杂交(aCGH)数据的仔细规范化对于准确检测拷贝数变化至关重要。在aCGH中使用的两个荧光团(通常是Cy5和Cy3)之间的标记亲和力差异可以作为强度分布内的一种偏差来观察。如果不加检查,这种偏差可能会在下游分析期间歪曲数据解释,并导致错误发现的数量增加。结果:在本研究中,我们开发了一种CGH。样条,一种自然三次样条插值方法,然后对异常值进行线性插值,能够快速有效地从大型aCGH数据集中去除大部分染色偏差。结论:我们已经表明,消除这种偏差并降低实验噪声对准确检测拷贝数变化(CNV)和拷贝数改变(CNA)的能力有着强烈的积极影响。
主页: http://www.google.de/#sclient=psy&hl=de&source=hp&q=Acgh.spline网站
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