摩尔 swMATH ID: 18622 软件作者: Petřek,M.,Košinová,P.,Koca,J.,Otyepka,M。 描述: MOLE:基于Voronoi图的分子通道、孔隙和隧道探索者。我们开发了一种算法“MOLE”,用于快速、全自动地定位和表征分子通道、隧道和孔隙。该算法已在互联网上免费提供(网址:http://mole.chem.muni.cz/)并克服了最近开发的CAVER软件的许多缺点和局限性。我们的MOLE算法的核心是Dijkstra的路径搜索算法,该算法应用于Voronoi网格。对多种生物分子系统的测试表明,MOLE算法表现良好,这些生物分子系统包括革兰西定、乙酰胆碱酯酶、细胞色素P450、钾通道、DNA四链体、核酶和大核糖体亚单位。因此,MOLE是探索大分子通道、复杂通道网络和分子动力学轨迹的有力工具,其中需要分析大量快照。 主页: http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0969212607003759 相关软件: 虚拟GL;打开Inventor;VizServer(VizServer);MeVisLab公司;N4itk公司;dcm4che公司;muView(多视图);探针浏览器;生物图像XD;TreeJuxtaposer树;MySQL数据库;DCMTK公司;VTK公司;PyMOL公司;ITK公司;OpenGL(OpenGL);抱怨 引用于: 3文件 全部的 前5名8位作者引用 1 吉尔·巴奎特 1 大卫·亚瑟·爱普斯坦 1 迈克尔·杜鲁门·古德里奇 1 伯恩德·哈曼 1 汉斯·克里斯蒂安·赫格 1 林森,拉尔斯 1 尼尔·马马诺 1 米歇尔·佩蒂让 连载1篇 1 数学与可视化 全部的 前5名在7个字段中引用 2 生物学和其他自然科学(92-XX) 1 总体主题;集合(00-XX) 1 几何图形(51至XX) 1 凸和离散几何(52至XX) 1 计算机科学(68至XX) 1 运筹学、数学规划(90-XX) 1 信息与通信理论、电路(94-XX) 按年份列出的引文