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摩尔

swMATH ID: 18622
软件作者: Petřek,M.,Košinová,P.,Koca,J.,Otyepka,M。
描述: MOLE:基于Voronoi图的分子通道、孔隙和隧道探索者。我们开发了一种算法“MOLE”,用于快速、全自动地定位和表征分子通道、隧道和孔隙。该算法已在互联网上免费提供(网址:http://mole.chem.muni.cz/)并克服了最近开发的CAVER软件的许多缺点和局限性。我们的MOLE算法的核心是Dijkstra的路径搜索算法,该算法应用于Voronoi网格。对多种生物分子系统的测试表明,MOLE算法表现良好,这些生物分子系统包括革兰西定、乙酰胆碱酯酶、细胞色素P450、钾通道、DNA四链体、核酶和大核糖体亚单位。因此,MOLE是探索大分子通道、复杂通道网络和分子动力学轨迹的有力工具,其中需要分析大量快照。
主页: http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0969212607003759
相关软件: 虚拟GL;打开Inventor;VizServer(VizServer);MeVisLab公司;N4itk公司;dcm4che公司;muView(多视图);探针浏览器;生物图像XD;TreeJuxtaposer树;MySQL数据库;DCMTK公司;VTK公司;PyMOL公司;ITK公司;OpenGL(OpenGL);抱怨
引用于: 3文件

连载1篇

1 数学与可视化

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