SeqBBS系列 swMATH ID: 17972 软件作者： H.Li、J.Vallandingham和J.Chen 描述： SeqBBS：一种基于变点模型的算法和R包，用于通过序列读取比率搜索CNV区域。随着微阵列技术的突破，下一代测序（NGS）技术进一步推进了现代生物医学研究的方法。高通量NGS技术目前常用于肿瘤和对照样本的分析，以研究DNA拷贝数变体（CNV）。特别是，肿瘤样本与对照样本的读取计数之比通常用于识别CNV区域。我们说明了变化点（或断点）检测方法以及贝叶斯方法特别适用于识别读取率数据中的CNV。我们将算法写入了一个用户友好的R包SeqBBS（表示测序数据的贝叶斯断点搜索），并将我们的方法应用于乳腺癌细胞系HCC1954及其匹配的正常细胞系BL1954之间读取比率的测序数据。成功识别了分隔不同CNV区域的断点。 主页： http://ieeexplore.ieee.org/document/6735925/ 依赖项： R（右） 相关软件： rSW序列；CNV-序列；读取深度 引用于： 2文件 3位作者引用 2 陈杰 1 Lee，Jaeeun先生 1 李华 连载1篇 1 统计计算与模拟杂志 在2个字段中引用 2 统计学（62-XX） 1 生物学和其他自然科学（92-XX） 按年份列出的引文