瑞士模式 swMATH ID: 17373 软件作者: T.Schwede、J.Kopp、N.Guex、M.C.Peitsch 描述: SWISS-MODEL:一个自动化的蛋白质同源性建模服务器。瑞士模式(http://swissmodel.expasy.org)是用于三维(3D)蛋白质结构自动比较建模的服务器。它从1993年开始开创了自动化建模领域,是当今使用最广泛的基于web的免费自动化建模工具。2002年,服务器计算出120 000个用户请求3D蛋白质模型。SWISS-MODEL通过其万维网界面提供了多个级别的用户交互:在“第一方法模式”中,只提交蛋白质的氨基酸序列来构建3D模型。模板选择、对齐和模型构建完全由服务器自动完成。在“对齐模式”中,建模过程基于用户定义的目标模板对齐。复杂的建模任务可以使用DeepView(Swiss-PdbViewer)的“项目模式”来处理,DeepView是一个集成的顺序到结构工作台。所有模型都通过电子邮件发送回来,并附有详细的建模报告。可选提供WhatCheck分析和ANOLEA评估。在EVA-CM项目中,不断评估SWISS-MODEL的可靠性。SWISS-MODEL服务器正在不断开发,以将专家知识成功应用到易于使用的服务器中。 主页: http://nar.oxfordjournals.org/content/31/13/3381.short 相关软件: PROCHECK检查;建模师;爆炸;PSI-爆炸;I-TASSER公司;QMEAN公司;LINCS系统;Gromacs公司;Pfam公司;UniProt公司;梅德勒;TRANSFAC公司;ClustalW公司;ElemStatLearn(电子状态学习);SMOTEBoost公司;协同因素;Q-SiteFinder;GROMOS公司;ChEMBL公司;国际有色人种协进会 引用于: 8文件 全部的 前5名22位作者引用 1 陈奎 1 弗洛里安·亨克 1 黄晓航 1 尼古拉·卡萨波夫。 1 Kumari,斯维塔 1 德克·拉布德 1 萨吉塔·卢鲁 1 马达维·萨斯特里。 1 拉贾尼·坎塔·马哈帕特拉 1 阿鲁穆加姆Mohana Priya 1 纳拉哈里·萨斯特里(Narahari Sastry),G。 1 苏伦达尔·雷迪 1 Route、Subhashree 1 斯里尼瓦斯,E。 1 穆罕默德·托奎尔 1 杰贝德·托马尔。 1 Vijayasarathy,K。 1 威廉·J·韦尔奇。 1 鲁本·扎马(Ruben H.Zamar)。 1 张,袁 1 郑楠 1 钟,杨 5篇连载文章中引用 三 计算生物学和化学 2 理论生物学杂志 1 统计计算与模拟杂志 1 医学中的计算和数学方法 1 施普林格手册 在4个字段中引用 7 生物学和其他自然科学(92-XX) 1 总体主题;集合(00-XX) 1 统计学(62-XX) 1 计算机科学(68至XX) 按年份列出的引文