可再生能源 swMATH ID: 17345 软件作者: Wang,J.,Wong,G.K.,Ni,P.,Han,Y.,Huang,X.,Zhang。 描述: RePS:一种序列汇编程序,用于屏蔽从鸟枪数据中识别的精确重复。我们描述了一个序列汇编程序RePS(repeat-masked Phrap with scaffolding),它明确地从散弹枪数据中识别准确的20mer重复,并在汇编之前删除它们。已建立的软件Phrap用于计算每个基的有意义错误概率。克隆末端配对信息用于构建排列和定向重叠群的支架。我们用人类和水稻的实际数据表明,即使覆盖范围只有4×到6×,尽管覆盖范围高达42.2 主页: http://genome.cshlp.org/content/12/5/824.short(短) 相关软件: 阿拉伯;重复遮罩;爆炸;第4.5条;JBROWSE公司;深渊;阿尔忒弥斯;全国广播公司;元数据IDBA;CEGMA公司;MetaGeneAnnotator(元基因注释器);MetaVelvet公司;InterProScan公司;阿波罗;GBrowse公司;PHRAP公司;制造商;制造商P;GRAIL公司;ECgene公司 引用于: 2文件 3位作者引用 1 Axelson-Fisk,玛丽娜 1 金旭(Kim,Jinwook) 1 朴光洙 2篇连载文章中引用 1 理论计算机科学 1 计算生物学 在4个字段中引用 1 概率论与随机过程(60-XX) 1 计算机科学(68-XX) 1 运筹学、数学规划(90-XX) 1 生物学和其他自然科学(92-XX) 按年份列出的引文