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深渊

swMATH ID: 17343
软件作者： Simpson，J.T.、Wong，K.、Jackman，S.D.、Schein，J.E.、Jones，S.J.、Birol，I。
描述： ABySS：短读序列数据的并行汇编程序。大规模并行脱氧核糖核酸（DNA）测序仪器的广泛采用促进了从头开始的短读汇编算法的最新发展。现有工具的一个共同缺点是，它们无法有效地汇编大规模测序项目产生的大量数据，例如对单个人类基因组进行测序，以编目自然遗传变异。为了解决这个限制，我们开发了ABySS（Assembly By Short Sequences），这是一个并行化的序列汇编程序。为了证明我们的软件的能力，我们从Illumina，Inc.公开发布的一名非洲男性基因组中收集了35亿个配对基因片段。大约有276万个长度≥100个碱基对（bp）的连续序列，N50大小为1499 bp，代表68个
主页： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2694472/
相关软件： 天鹅绒;SPAdes公司;码头;IDBA-UD公司;SOAPdenovo公司;仪表;ALLPATHS公司;蛛形纲;OMGS公司;卡努;美洲开发银行;MEGAHIT公司;艺术;SSAKE公司;SHARCGS公司;QSRA公司;元数据IDBA;虾;关贸总公司;github
引用于： 14文件
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46位作者引用

2 克里斯蒂娜·鲍彻
2 利纳·萨梅拉
1 阿库尼亚，维森特
1 Aleksandrov，A.V.公司。
1 巴哈州阿里帕纳希
1 阿兰塞（Ana M.Aransay）。
1 Axelson-Fisk，玛丽娜
1 鲍拉·博尼佐尼
1 吉安卢卡·德拉·维多瓦
1 波琳娜·德罗兹多娃
1 托马斯·加特
1 罗伯托·格罗西
1 迈克尔·哈肯伯格
1 汤姆·哈特曼
1 意大利，朱塞佩·弗朗西斯科
1 吉恩·盖拉尔丁
1 姜涛
1 哈萨克斯坦。
1 斯里拉姆·克里希纳莫尔蒂
1 米林·纳拉扬劳·库尔卡尼
1 刘永超
1 斯特凡诺·洛纳尔迪
1 马丁·穆格利。
1 穆克吉、金舒克
1 潘伟华
1 尤里·皮罗拉
1 马尔科·普雷维塔利
1 西蒙·普格利西。
1 安德烈亚·拉杜列斯库
1 瑞兹、拉斐拉
1 罗密欧·里兹
1 罗德里格斯-埃兹佩列塔，奈亚拉
1 马西米利亚诺·罗西
1 伊雷娜·鲁苏
1 彼得·里沙夫
1 古斯塔沃·萨科莫托
1 法国玛丽·萨戈
1 贝蒂尔·施密特
1 Alexey A.Sergushichev。
1 A.A.沙利托。
1 布莱里娜·西奈梅里
1 彼得·斯塔德勒（Peter F.Stadler）。
1 Tsarev，F.N。
1 冯·洛尼森，萨拉
1 克里斯托弗·赖特
1 Zhi elezn，Filip先生

4篇连载文章中引用

2 算法
1 数据挖掘与知识发现
1 计算生物学
1 萨拉托夫斯科戈大学。诺瓦亚·塞里亚。Seriya Matematika、Mekhanika、Informatika
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在7个字段中引用

12 生物学和其他自然科学（92-XX）
6 计算机科学（68至XX）
三 组合数学（05-XX）
2 运筹学、数学规划（90-XX）
1 总体主题；集合（00-XX）
1 概率论与随机过程（60-XX）
1 统计学（62-XX）

按年份列出的引文