F-序列 swMATH编号: 17297 软件作者: 描述: F-Seq:高通量序列标签的特征密度估计器。摘要:使用高通量测序技术的标签测序现在经常被用来确定特定的序列特征,例如转录因子结合位点(ChIP-seq)或开放染色质区域(DNase-seq。为了直观地将单个序列数据汇总并显示为准确且可解释的信号,我们开发了F-Seq,这是一个软件包,可以生成连续的标签序列密度估计,从而识别生物意义位点,这些位点的输出可以直接显示在UCSC基因组浏览器中。可用性:该软件是用Java语言编写的,可在所有主要计算平台上下载,网址为http://www.genome.duke.edu/labs/furey/software/fseq。 主页: http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/24/21/2537.short 相关软件: KEGG公司;针织者;烤面包;银河;功能计数;R子阅读;重新计票;正确;基因组图;轨道司机;Gviz公司;GeneHug-GEPIS公司;变量注释;SSAHA公司;变量工具;GSNAP公司;BEDOPS公司;吉诺维兹;Cutadapt公司;BED工具 引用于: 3文件 全部的 前5名被11位作者引用 1 彼得·约翰·比克尔 1 詹姆斯·布朗。 1 陈佳佳 1 肖恩·戴维斯。 1 丁,敏 1 黄海燕 1 李群华 1 数学,埃维 1 沈白蓉 1 王海云 1 徐忠华 3篇连载文章中引用 1 医学中的计算和数学方法 1 应用统计学年鉴 1 分子生物学方法 在3个字段中引用 2 统计学(62-XX) 2 生物学和其他自然科学(92-XX) 1 数值分析(65-XX) 按年份列出的引文