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F-序列

swMATH编号: 17297
软件作者:
描述: F-Seq:高通量序列标签的特征密度估计器。摘要:使用高通量测序技术的标签测序现在经常被用来确定特定的序列特征,例如转录因子结合位点(ChIP-seq)或开放染色质区域(DNase-seq。为了直观地将单个序列数据汇总并显示为准确且可解释的信号,我们开发了F-Seq,这是一个软件包,可以生成连续的标签序列密度估计,从而识别生物意义位点,这些位点的输出可以直接显示在UCSC基因组浏览器中。可用性:该软件是用Java语言编写的,可在所有主要计算平台上下载,网址为http://www.genome.duke.edu/labs/furey/software/fseq。
主页: http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/24/21/2537.short
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