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TRANSWESD:用传递性约化推断细胞网络。动机:区分直接影响和间接影响是生物网络逆向工程的中心问题,因为它有助于检测和去除假阳性边缘。传递约化是消除反映间接效应的边的一种方法,但它在重构具有真正冗余结构的循环交互图时存在问题。结果:我们提出了TRANSWESD,它是加权有向图传递性约简的一个详细变体,它克服了现有版本的概念问题。主要的变化和改进包括:(1)从系统扰动实验生成高质量扰动图的新统计方法;(ii)使用边缘权重(关联强度)来识别真正的冗余结构;(iii)对周期的因果解释;(四)传递性归约的宽松定义;和(v)大型网络的近似算法。通过使用标准化的基准测试,我们证明了我们的方法优于现有的传递性约简变体,并且尽管其概念简单,但与其他逆向工程方法相比具有很强的竞争力。