SeqMap（序列图） swMATH ID: 17145 软件作者： 姜浩、王浩 描述： SeqMap：将大量寡核苷酸映射到基因组。SeqMap是一种将大量短序列映射到基因组的工具。它被设计用于查找参考基因组中每个序列可能来自的所有位置。这项任务对于分析超高通量测序机的数据至关重要。通过精心设计的索引过滤算法和高效的实现，SeqMap可以将数千万个短序列映射到数十亿个核苷酸的基因组中。序列中核苷酸碱基的多次替换和插入/缺失可以耐受，因此可以检测到。SeqMap支持FASTA输入格式和各种输出格式，并提供了用于调优映射过程几乎每个方面的命令行选项。典型的映射可以在台式PC上几个小时内完成。在集群上并行使用SeqMap也非常简单。 主页： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2562015/ 相关软件： ClustalW公司；DIALIGN公司；浮雕；维也纳RNA；RAST公司；顶帽；虾；Clustal X公司；KEGG公司；香皂；ARB公司；最小值；埃米尔吉；标签清理器；OligoWalk公司；最优RNAi；阿斯塔拉维斯塔；预GPI；SPEPlip公司；BaCelLo公司 引用于： 3文件 全部的 前5名6位作者引用 1 穆拉德埃卢米 1 姜慧 1 埃内斯托·皮卡迪 1 朱莉娅·萨尔兹曼 1 王永红（Wong，Wing Hung） 1 阿尔伯特·Y·佐马亚。 2篇连载文章中引用 1 统计科学 1 分子生物学方法 在4个字段中引用 三 生物学和其他自然科学（92-XX） 2 总体主题；集合（00-XX） 1 统计学（62-XX） 1 数值分析（65-XX） 按年份列出的引文