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雷纳兹

swMATH ID: 17118
软件作者: Gruber AR、Findeiss S、Washietl S、Hofacker IL、Stadler PF
描述: Rnaz 2.0:改进非编码RNA检测。RNAz是一个广泛使用的软件包,用于重新检测比较基因组数据中的结构化非编码RNA。四年的经验不仅证明了该方法的适用性,还帮助我们确定了当前实施的局限性。RNAz 2.0在两个方面提供了显著的改进:(1)系统地使用二核苷酸模型提高了准确性。(2) 前一版本的技术局限性,例如无法处理六个以上序列的比对,通过增加训练数据和使用熵度量来表示序列相似性来克服。与前一版本相比,RNAz 2.0在二核苷酸背景模型上的错误发现率显著降低。结构线形的单独模型提供了一种增加预测能力的额外方法。RNAz是开源软件,可通过以下网站免费获得:网址:http://www.tbi.univie.ac/清洗/RNz
主页: 网址:http://www.tbi.univie.ac/~清洗/RNz/
相关软件: 生物导体;法国皇家医学会;R(右);维也纳RNA;顶帽;KEGG公司;边缘R;无间道;打开DMAP;NoFold公司;卡纳;记录仪;RNA集群;IgRepertoire构造函数;GraphClust(图形俱乐部);RNA表面;Rnall公司;梅维;RNA链;格拉维斯托
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