双ExpSeq swMATH ID: 17050 软件作者： 肖恩·鲁迪 描述： R包DoubleExpSeq：通过离散参数的经验贝叶斯收缩对RNA-Seq数据进行差异外显子使用测试。RNA-Seq数据的差异外显子使用测试通过离散参数的经验贝叶斯收缩法，利用包含排除数据分析跨组跳过外显子的倾向。输入数据由两个矩阵组成，其中每行表示一个外显子，列表示生物样本。第一个矩阵是每个样本表达外显子的读取数。第二个矩阵是表示外显子或在样本中明确跳过外显子的读取次数的计数，即总计数矩阵。将这两个矩阵相除，得出表示每个样本的外显子表达倾向与跳过外显字的比例。 主页： https://cran.r-project.org/web/packages/DoubleExpSeq/index.html 源代码： https://github.com/cran/DoubleExpSeq网站 依赖项： R（右） 相关软件： MOABS公司；全球气候变化评估；BaySeq公司；拼接接头；rSeqDiff（序列差异）；EB序列；顶帽；DiffSplice（扩散拼接）；Voom公司；利马；数据序列；边缘R；生物导体；R（右）；CRAN（起重机） 引用于： 1文件 3位作者引用 1 玛拉·约翰逊 1 伊丽莎白·普多姆 1 肖恩·鲁迪 连载1篇 1 应用统计学年鉴 在2个字段中引用 1 统计学（62-XX） 1 生物学和其他自然科学（92-XX） 按年份列出的引文