MetaPSICOV公司 swMATH ID: 17012 软件作者： David T.Jones、Tanya Singh、Tomasz Kosciolek、Stuart Tetchner 描述： MetaPSICOV：结合协同进化方法准确预测蛋白质接触和长程氢键。动机：推断残基对之间直接进化耦合的统计技术的最新发展使得基于协变量的接触预测成为准确的蛋白质3D建模的可行方法，除了所需的序列之外，没有其他信息。为了扩展接触预测的有用性，我们设计了一种新的meta-predictor（MetaPSICOV），它结合了三种不同的方法来从多序列比对中推断协变信号，考虑了广泛的其他序列衍生特征，并且，唯一的，描述输入多序列比对的局部和全局质量的一系列度量。最后，我们使用两阶段预测器，其中第二阶段过滤第一阶段的输出。此外，还评估了该两阶段预测器准确预测氢键远程网络的能力，包括正确分配施主和受体残基。结果：使用由150个蛋白家族组成的原始PSICOV基准集，MetaPSICOV对预测的顶级L远程接触达到0.54的平均精度，约为60 主页： http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/31/7/999.short 相关软件： 剂量；阿波罗；DBAli工具；MATRAS公司；NUCPLOT公司；LIGPLOT公司；EMBOS公司；焦耳（Jmol）；PhenomeNET公司；智能GO；啤酒节；FUNC公司；Aber-OWL公司；工厂TFDB；鸡蛋NOG；ELM公司；数据库CAN；抗SMASH；解剖HMMER；HPMV（高压中压）；安妮 引用于： 1文件 2位作者引用 1 卡鲁戈语、奥利维埃罗语 1 弗兰克·艾森哈伯 连载1篇 1 分子生物学方法 在2个字段中引用 1 统计学（62-XX） 1 生物学和其他自然科学（92-XX） 按年份列出的引文