浪子 swMATH ID: 16997 软件作者： Doug Hyatt、Gwo-Liang Chen、Philip F LoCascio、Miriam L Land、Frank W Larimer、Loren J Hauser 描述： 原核生物：原核基因识别和翻译起始位点鉴定。背景：过去十年来，微生物自动基因预测的质量稳步提高，但仍有改进的余地。增加正确识别的数量，包括基因和每个基因的翻译起始位点的数量，以及减少假阳性的总数，都是理想的目标。结果：凭借我们多年为联合基因组研究所手动管理基因组的经验，我们开发了一种新的基因预测算法，称为Prodigal（原核动态编程基因发现算法）。通过Prodigal，我们特别关注三个目标：改进基因结构预测、改进翻译起始位点识别和减少假阳性。我们将Prodigal的结果与现有的基因发现方法进行了比较，以证明它满足了每一个目标。结论：我们构建了一个快速、轻量级、开源的基因预测程序，名为Prodigalhttp://compbio.ornl.gov/prodigal/。与现有方法相比，Prodigal取得了良好的结果，我们相信它将是自动化微生物注释管道的宝贵资产。 主页： http://compbio.ornl.gov/prodigal/ 相关软件： HMMER公司；易捷基因；R（右）；克里蒂卡；TICO公司；基因标记S；UniProt公司；InterProScan公司；SPAdes系列；马格西；布拉特；HH闪电；Cd命中；Samtools公司；肌肉；生物钟；香皂；MAFFT公司；生物蟒蛇；魔法爆炸 引用于： 3文件 全部的 前5名6位作者引用 1 卡鲁戈语、奥利维埃罗语 1 弗兰克·艾森哈伯 1 穆罕默德·埃尔·凯比尔 1 乔纳森·基思（Jonathan M.Keith）。 1 帕拉什·萨希塔尔 1 张传义 连载1篇 2 分子生物学方法 在3个字段中引用 三 生物学和其他自然科学（92-XX） 1 总体主题；集合（00-XX） 1 统计学（62-XX） 按年份列出的引文