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促销3D

swMATH ID: 16918
软件作者: Pei Jimin,Nick V.Grishin
说明: PROMALS3D:进化和三维结构信息增强的多蛋白序列比对。多序列比对(MSA)是一种重要的工具,在生物信息学和计算生物学中有许多应用。准确构建差异蛋白的MSA仍然是一项困难的计算任务。公共数据库中不断增加的蛋白质序列和结构可用于提高比对质量。PROMALS3D是一种用于蛋白质MSA构建的工具,通过数据库搜索获得额外的进化和结构信息来增强。PROMALS3D自动识别输入蛋白质序列和结构数据库中的同源物,从三维结构的比对中导出基于结构的约束,并将其与基于序列的纵断面-纵断面比对约束结合在一个基于一致性的框架中,构建高质量的多序列比对。PROMALS3D输出是一种共识比对,富含关于输入蛋白质及其同源物的序列和结构信息。PROMALS3D Web服务器和软件包可从以下网址获得://prodata公司。游泳。教育/提示3d。
主页: http://rd.springer.com/protocol/10.1007/978-1-62703-646-7_17
相关软件: SAB标记;肌肉;MAFFT公司;指南2;罢工;蛋白石;里昂;RASCAL公司;普罗瓦林;PCMA公司;充分满足;PMFastR项目;镶嵌面;莫韦;TCS(牵引力控制系统);合并对齐;装饰铝;国际RMSD;重新校准器;AlexSys公司
引用于: 3文件

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