元障碍 swMATH ID: 16901 软件作者： Lukasz P Kozlowski、Janusz M Bujnicki 描述： MetaDisorder：预测蛋白质内在紊乱的元服务器。背景：内源性非结构蛋白（IUP）缺乏明确的三维结构。其中一些分子在特定条件下（例如与另一分子相互作用时）可能具有局部稳定的结构，而其他分子则以永久非结构化状态工作。IUPs的发现对传统的蛋白质结构范式提出了挑战，该范式认为特定的明确定义的结构定义了蛋白质的功能。截至2011年12月，已经公开了大约60种根据序列计算预测蛋白质紊乱的方法。它们基于不同的方法，例如利用进化信息、能量函数以及各种统计和机器学习方法。结果：鉴于现有内在障碍预测方法的多样性，我们决定测试是否有可能将它们组合成更准确的元预测方法。我们开发了一种基于任意选择的13个疾病预测因子的方法，其中最终共识通过方法的准确性进行加权。我们还开发了一种疾病预测因子GSmetaDisorder3D，该预测因子不使用第三方疾病预测因子，而是与蛋白质折叠识别方法报告的已知蛋白质结构对齐，以推断潜在的结构化和非结构化区域。继我们的障碍预测因子在CASP8基准测试中取得成功后，我们将它们组合成一个名为GSmetaDisorderMD的meta-meta预测因子，这是后续CASP9基准测试中的最高评分方法。结论：本文中描述的一系列障碍预测因子可作为MetaDisorder web服务器访问http://iimcb.genesilico.pl/metadorder/。结果以易于理解的交互式模式和适合机器处理的简单文本格式呈现。 主页： http://iimcb.genesilico.pl/metadorder/ 相关软件： 剂量；阿波罗；DBAli工具；MATRAS公司；NUCPLOT公司；LIGPLOT公司；EMBOS公司；焦耳（Jmol）；PhenomeNET公司；智能GO；啤酒节；FUNC公司；Aber-OWL公司；工厂TFDB；鸡蛋NOG；ELM公司；数据库CAN；抗SMASH；解剖HMMER；HPMV（高压中压）；安妮 引用于： 1文件 2位作者引用 1 卡鲁戈语、奥利维埃罗语 1 弗兰克·艾森哈伯 连载1篇 1 分子生物学方法 在2个字段中引用 1 统计学（62-XX） 1 生物学和其他自然科学（92-XX） 按年份列出的引文