瓦兹莫洛

VaZyMolO:一种定义和分类病毒蛋白质模块性的工具。病毒结构基因组计划旨在揭示未知病毒蛋白的功能,通过高通量方法确定其三维结构,并通过折叠同源性研究确定其功能。已开发出“病毒酶模块定位”(VaZyMolO)工具,其目的是确定可能以可溶性和功能活性形式表达的病毒蛋白模块,从而确定结晶研究的候选。VaZyMolO包含114个完整的病毒基因组序列,包括阴性和阳性的单链RNA病毒。在VaZyMolO中,模块被定义为一个结构和/或功能单元。首先通过同源性搜索识别模块,然后通过序列组成分析、基序搜索、跨膜区域搜索和域定义的结果的收敛性进行验证。VaZyMolO的公共接口,可从http://www.vazymolo.org,允许将查询序列与已知函数的所有VaZyMolO模块进行比较。