阿迪普埃姆

快速详尽的多分辨率对接,实现高吞吐量覆盖。动机:需要有效的拟合工具来利用从晶体学或比较模型快速增长的蛋白质结构域原子模型,以及更大分子组装体的低分辨率密度图。在这里,我们报告了一种新的拟合算法,用于将部分高分辨率模型详尽而快速地覆盖到低分辨率密度地图中。该方法结合了基于球谐函数的快速旋转搜索和简单的平移扫描。结果:这种新的组合使得能够在几秒到几分钟的时间内将原子结构精确地连接到低分辨率的电子密度图中。通过模拟和实验测试用例实现的高效性保留了这些异构分辨率合并工具所需的穷尽性。结果表明,该算法具有高效、鲁棒性和高吞吐量覆盖率的特点。可用性:http://sbg.cib.csic.es/Software/ADP_EM


zbMATH参考文献(参考

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