电机原理图 swMATH ID: 16892 软件作者： Mitul Saha、Michael Levitt、Wah Chiu 描述： MOTIF-EM：一种自动计算工具，用于识别CryoEM结构中的保守区域。我们提出了一种新的、同类第一的、全自动计算工具MOTIF-EM，用于识别大分子组装（如伴侣蛋白、病毒等）的低温EM图中保持构象保守的区域、域或基序。作为副产品，结构中不保守的区域被揭示出来：这可以表明与生物活性相关的局部分子灵活性。MOTIF-EM将低温电磁体积图作为输入。MOTIF-EM用于检测保守子结构的技术受到了2D物体识别领域最近的一项突破的启发。该技术通过在输入的低温EM图中构造局部区域的旋转不变的低维表示来工作。通过输入映射，在简化表示（通过使用简单度量进行比较）之间建立对应关系。使用哈希表对对应进行聚类，并使用图论检索保守的结构域或基序。MOTIF-EM已被用于提取出现在大分子组装图中的保守结构域，包括病毒P22和epsilon 15、核糖体70S、GroEL的结构域，它们在不同功能状态下保持结构保守。我们的方法还可以用于为一些映射构建原子模型。我们还使用MOTIF-EM鉴定了dsDNA噬菌体HK97、Epsilon 15和ó29之间共享的保守折叠，尽管它们具有低序列相似性。 主页： http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/26/12/i301.short 相关软件： 剂量；阿波罗；DBAli工具；MATRAS公司；NUCPLOT公司；LIGPLOT公司；EMBOS公司；焦耳（Jmol）；PhenomeNET公司；智能GO；Ontobee公司；FUNC公司；Aber-OWL公司；工厂TFDB；鸡蛋NOG；ELM公司；数据库CAN；抗SMASH；解剖HMMER；HPMV（高压中压）；安妮 引用于： 1文件 2位作者引用 1 卡鲁戈语、奥利维埃罗语 1 弗兰克·艾森哈伯 连载1篇 1 分子生物学方法 在2个字段中引用 1 统计学（62-XX） 1 生物学和其他自然科学（92-XX） 按年份列出的引文